乙型肝炎病毒相关性肾炎的发生，是由于人体感染了乙型肝炎病毒以后，通过免疫反应形成免疫复合物，导致肾小球肾炎的发生，或者乙型肝炎病毒直接侵犯肾脏组织，而引起肾小球肾炎。
乙型肝炎病毒相关性肾炎是不是会影响肝功能，主要是取决于患者乙型肝炎病毒是处于活动期还是稳定期，一般大多数患者的肝功能都正常，但是也有少部分患者，由于合并有慢性迁延性的肝炎，慢性活动性的肝炎有肝硬化，甚至出现的是急性重症肝炎，表现有肝功能异常，从而导致患者转氨酶明显升高，患者感觉四肢乏力、腹胀、不想吃东西、消瘦、皮肤黄疸。
如果乙型肝炎病毒相关肾炎在进行激素，或者免疫抑制剂治疗的过程中，要明确观察肝功能的变化，避免出现肝功能异常。