生殖器疱疹的治疗方法一般可以选择使用口服药物配合外用药物，也可以选择使用静脉输液的方式进行综合治疗。
口服药物方面主要以抗病毒类的药物为主，比如盐酸伐昔洛韦，或者是泛昔洛韦，还可以配合口服提高免疫力的药物，比如胸腺肽肠溶片或者是匹多莫德颗粒。
而外用药物方面则建议选择使用抗病毒类的药膏，比如阿昔洛韦乳膏或者是重组人干扰素凝胶，综合治疗对于整体的恢复有一定的帮助。
如果自身的症状比较重，也可以选择使用静脉输液的方式进行治疗，可以静脉输液更昔洛韦，也可以选择使用注射用喷昔洛韦溶液进行治疗，对于整体的恢复有一定的帮助。