百日咳是由百日咳杆菌导致的急性的呼吸道传染病，百日咳患者是最主要的传染源，隐性感染者和带菌者也是传染源。百日咳患者痉挛性咳嗽发生后的30天，或者是发病以后的40天内都是有传染性的，需要隔离治疗。
白日咳可以通过呼吸道飞沫传播，家庭内的传播较为多见。百日咳杆菌感染后可以产生百日咳外毒素，引起支气管和细支气管黏膜的损害，造成呼吸道的上皮细胞坏死，黏膜广泛炎症和破坏，出现痉挛性的咳嗽、咳痰等症状。
接种百日咳疫苗是预防百日咳发生的最好方法。