青霉素和红霉素的主要区别在于，青霉素属于β-内酰胺类的抗生素药物，而红霉素属于大环内酯类抗生素。
青霉素是出现较早的一种抗生素，在应用中需要注意，有的患者可出现药物过敏，所以使用前需做皮肤试验。提示阳性者不能使用，只有皮试阴性才可以应用。
红霉素也是一种有较广谱抗菌作用的抗生素，其对支原体、衣原体、球菌、厌氧菌等有着较好的疗效。药物成分主要通过肝脏代谢，具有一定的肝脏毒性，尤其长期应用可影响心脏，所以要特别注意。