心口窝下面痛的原因有很多，由于这个位置在上腹部，因此最常见于消化系统疾病，如胃和十二指肠疾病、急性胰腺炎以及胆道疾病等。
除了消化系统疾病以外，冠心病的患者发生心绞痛或者心肌梗塞，也可以表现为上腹疼痛。这种不典型的心肌缺血引起的疼痛容易被认为是消化系统疾病所引起，因此需要及时做心电图、心肌损伤标志物等检查，以明确诊断，以免误诊导致不良的后果。
此外，神经官能症的患者也可以出现功能性的上腹疼痛，要及时到医院明确诊断，积极处理相关的疾病。