患者在解小便时有疼痛感时，其病因需要根据患者疼痛的特点，以及有无其他伴随症状综合分析后判断，因为泌尿生殖系统相关疾病都可能会导致患者出现这一症状。
如果患者排出的尿液明显发黄，还有明显的尿频、尿急症状，则考虑为发生了急性尿道炎所导致的。这是由于发生急性尿道炎时细菌引起尿道黏膜炎性水肿，甚至糜烂所引起的。这类患者应该及时予以敏感抗生素积极抗炎治疗，虽然排尿时有疼痛症状，但仍然需要多饮水增加排尿，可促进急性尿道炎治愈。
如果伴有排尿困难，且排尿时前列腺部位疼痛更为明显，则考虑为急性前列腺炎所致。前列腺将尿道包裹在其中，发生急性前列腺炎时前列腺可出现肿大压迫尿道，排尿时会刺激发生炎症的前列腺而出现疼痛症状。需要及时到泌尿外科就诊，积极抗炎治疗。