肛周脓肿并不是肛瘘，肛周脓肿有可能会导致肛瘘，但是这仍然是两种不同疾病。
肛周脓肿，顾名思义是肛门周围的脓肿，大部分是金黄色葡萄球菌所引起的肛周皮肤，以及软组织化脓性炎症，并且已经形成了脓肿、脓腔。在这种情况下应该积极地进行抗感染治疗，假如经过这些治疗效果不理想，还应该进行手术切开引流。如果治疗不及时，肛周脓肿有可能会向肛门齿状线以上的直肠黏膜部分破溃，这种情况下就会造成直肠黏膜和皮肤之间的一个瘘道，我们称之为肛瘘。
由此可见，肛瘘有可能是肛周脓肿引起的，但是肛瘘本身并不是肛周脓肿。