脑干损伤的辅助检查包括：
1，腰椎的穿刺。一般行腰椎穿刺，可以发现压力正常或者是轻度的增高，大多数呈血性的脑脊液。
2，x平片。颅骨骨折发生率较高。可以根据骨折的部位，结合受伤的机制推测脑干损伤的情况。
3，ct磁共振扫描，原发性脑干损伤表现为脑干肿大。有点片状的密度增高区域。脚间池，桥池，四叠体池以及第四脑室受压或者是闭塞。继发性的脑干损伤除显示继发性的病变的征象以外，还可以见脑干受压扭曲向对侧移位。头颅磁共振可以显示脑干内小出血灶以及挫伤灶，由于不受骨性伪影的影响，显示较ct更为清楚。
4，脑干听觉诱发电位。通过脑干听觉诱发电位，可以反映脑干损伤的平面以及损伤的程度。