如果男性下体瘙痒为真菌感染所引起，具有一定的传染性，应当外用抗真菌的软膏进行治疗，比如氟康唑软膏。
当真菌感染特别严重时，还应当配合口服的药物进行治疗，比如伊曲康唑，在使用药物之前可以先外用低浓度的高锰酸钾溶液进行外洗。男性下体出现一些过敏反应时也会引起瘙痒的症状，可以使用氯雷他定等药物进行治疗，症状特别明显时还应当配合使用糖皮质激素软膏予以缓解。
如果男性下体瘙痒为细菌感染所导致，主要是使用抗生素类的药物治疗，比如红霉素软膏。