二者区别有以下几点：
第一，病因，肝肺综合征的病因是急慢性肝病，主要是肝硬化引起的，肝性脑病的病因是重型中毒性肝炎、药物性肝炎等。
第二，临床特点，肝肺综合征的临床表现为原发性肝病的表现和肺功能障碍的表现。原发性肝病的表现为蜘蛛痣、黄疸、肝脾肿大等。肺功能表现主要是呼吸困难。肝性脑病的主要临床特点为原发性肝病的特点还伴有性格改变、智能受损、意识障碍等。
第三，治疗，肝肺综合征治疗包括吸氧治疗、栓塞治疗、手术治疗等。肝性脑病治疗为去除肝性脑病的诱因，减少氨吸收和加强氨的排出。