多囊肾用不用手术切除，主要取决于患者的病情。如果患者能够使用药物控制症状，就不需要做手术。
如果患者使用止痛剂，并不能缓解疼痛，同时药物也不能控制高血压时，可以选择肾脏切除或者囊肿去顶减压手术；如果患者的囊肿出血量较大，也可以选用手术治疗；如果当患者影响肝脏功能时，出现门静脉高压、呼吸困难、腹胀等情况时，医生也可以合理的选择手术治疗。
如果患者颅内动脉瘤直径较大时，或者患者有多囊肾脑出血家族史，医生要重视这类患者，可采用手术治疗方法。