口腔菜花病的治疗方法主要有药物治疗、手术治疗以及中医中药治疗等，具体采用哪一种方法进行治疗，主要取决于患者的病情程度。
对于病情轻微的患者，可先通过药物来进行治疗，在治疗期间还需留意观察疾病的进展情况。对于病情严重的患者，通常需要进行手术治疗，以此来切除病变的粘膜。
在治疗期间患者也可以服用一些中药，有助于缓解症状。口腔菜花病不但会影响患者的生活质量，而且还有可能发生癌变，因此一旦确诊后，及早治疗是关键。