在通常情况下，药物中毒有明显的后遗症。
首先，如果没有及时、彻底地清洗胃内部，会对胃肠道留下副作用和后遗症，例如出现胃黏膜的损伤和刺激，造成反酸、烧心、恶心、呕吐、腹痛、胃肠道的食物消化和吸收不良，这些属于消化系统的后遗症。
另外，还有可能造成循环系统的后遗症。患者有可能出现胸闷、气短、心悸、心前区不适、心律失常乃至心力衰竭。另外，患者有可能出现呼吸系统的后遗症，例如严重的百草枯中毒会造成肺纤维化等。
另外，对于一些肉毒杆菌食物中毒，还有可能造成神经系统的后遗症，导致头晕、头痛、植物神经功能紊乱等。