先天性小睾症无精子症，一般需要到医院进行检查性激素和染色体。
如果性激素及染色体有异常，采用的治疗方法多为药物治疗，药物治疗主要采用性激素治疗的方法，补充体内的雄性激素，可能需要长期进行补充。
而对于无精子症导致的不孕症的治疗，则主要采用试管婴儿的方法。试管婴儿分为供精试管婴儿以及夫精试管婴儿。对于先天性小睾症无精子症的患者，主要用供精试管婴儿的方法来进行助孕，供精试管婴儿即采用精子库的精子，使用供精的方法能够帮助先天性小睾症无精子的患者获得后代。