确诊希恩综合征，要首先了解既往病史，明确是否有过大出血病史。其次，再借助实验室检查，以及影像学检查就能够确诊。
希恩综合征的实验室检查，主要是依据激素水平进行检测。进行垂体激素检测试验，会发现促卵泡生成素、促黄体生成素、泌乳素都是处于降低的状态；甲状腺功能检测各项指标减低；检测肾上腺素会发现皮质醇水平整体下降、血糖降低；卵巢功能检查出现雌孕激素下降、睾酮下降，同时血常规还有明显的三系细胞减少现象。
其次，就是借助影像学检查，用彩超监测子宫卵巢处于萎缩变小的状态，检测到没有卵泡的发育、没有排卵的出现；做头颅CT检查或者是核磁共振检查，会显示垂体体积萎缩变小，而且大部分的患者密度是减低的，在颅内的蝶鞍区会呈现一种空间样的回声，就是典型的空状蝶鞍表现。
根据这些就可以对希恩综合征作出诊断。