不完全肠梗阻的治疗分为保守治疗和手术治疗两种，一般是以保守治疗为主，给予禁食水、持续胃肠减压、静脉抗感染、解痉止痛，口服润肠通便的药物治疗，还可以给予灌肠通便治疗。
根据不完全性肠梗阻的病因不同，采取的治疗也是不同的。如果是腹腔脏器或者是肠管的炎症刺激造成的肠管扭转、痉挛造成的肠道内容物通过受阻的情况时，是需要给予抗生素治疗的。
如果不是炎症刺激造成的肠梗阻，但是肠梗阻时间较长，也建议应用抗生素来预防肠道内的感染情况。