如果女性有卵巢巧克力囊肿而且有生育要求，那可能就要进行以下方式来备孕：
如果巧克力囊肿比较小，可以直接在排卵期的时候安排同房来备孕怀孕，也有可能需要用排卵试纸来监测排卵，或者直接做阴超监测排卵。因为小的卵巢巧克力囊肿往往不会影响正常受孕。
但是如果女性的巧克力囊肿比较大，而且也不想手术，那可以考虑先服用米非司酮或者是孕三烯酮，让巧克力囊肿缩小然后再进行备孕。
还有一些巧克力囊肿患者要先做手术将巧克力囊肿摘除，术后再肌注亮丙瑞林，停药以后再考虑备孕。