9个月的宝宝发烧39℃，此时需要按照医生的嘱咐，给宝宝服用儿童类的退烧药物进行治疗，比如布洛芬或者对乙酰氨基酚等。
同时可以给宝宝进行物理降温，包括额头局部贴退热贴、身上使用温水擦浴、头枕部放置冰袋等。还要及时化验血常规、尿常规、便常规，以及血生化、C-反应蛋白等实验室检查，明确引起宝宝发烧的病因。
如果是细菌感染引起的发烧，遵医嘱使用头孢、青霉素，或者大环内酯类抗生素进行治疗。如果是病毒感染导致，需要积极对症治疗，避免病情继续加重而导致脑膜炎、心肌炎、肾炎等并发症的出现。