神经源性膀胱的治疗是一个相对复杂的过程，可以包括首要和次要的目标，首要目标是保护上尿路的功能，次要目标是恢复下尿路的功能，预防泌尿系感染，提高生活质量。
其治疗方法可以总体上分为非手术治疗和手术治疗两种，非手术治疗可以使患者行为锻炼盆底肌肉，采用手法辅助排尿，如排尿时用手按压膀胱、间歇性导尿等方法治疗， 同时可以根据患者的尿动力学表现选择药物治疗，如α受体阻滞剂等。
此外还可以行手术治疗如膀胱扩大术、人工尿道括约肌置入术以及膀胱起搏器等方法治疗。