龟头上存在小肉粒的处理办法，首先需要观察肉粒的大小。如果肉粒是散在的以及均一的，比如针尖般的小肉粒，考虑是阴茎珍珠样丘疹，属于一种良性病变，对健康是没有影响，也不会癌变，也是没有传染性。建议患者进行局部清洗，需要局部的清洁卫生就可以。
如果肉粒好像芝麻般大小，同时不断增大、容易破溃，需要怀疑属于尖锐湿疣，有可能跟不洁性生活史有关系。建议患者有必要及早到正规医院泌尿外科接受检查治疗，有必要时可以要接受激光手术治疗或者冷冻治疗。假如有包皮过长，建议行包皮手术。