胆囊术后的后遗症，最常见的是消化功能的改变，极少数患者会出现胆瘘。
由于胆囊具有贮存、浓缩胆汁的作用，对脂肪和蛋白质、维生素等的代谢和吸收具有重要作用，因此，胆囊切除术后的患者在短期内可能出现相应的消化道症状，如腹胀、恶心、呕吐、食欲不振、消化不良，病人消瘦或出现脂肪泻等。
但由于胆囊本身并不分泌胆汁，人体的胆汁大部分是由肝细胞合成的，部分可由胆管细胞合成，胆囊只起到一个贮存的作用，因此虽然短期内人体会有些不适应，但时间久了，肝细胞和胆管内的胆汁，足以达到代替或替代的作用，所以远期并无什么太大的后遗症。