在临床当中它俩最根本的区别就是位置的不同，急性枕骨大孔疝这个是小脑以及脑干从枕骨大孔的地方，突出于颅腔外侧从而形成了这种脑疝的表现形式。
而小脑幕裂孔疝，则是大脑在小脑幕的边缘出现了下移的表现，进入到了小脑的范围，这个是叫做小脑幕裂孔疝。
从临床表现上来讲，急性枕骨大孔疝，它会在非常早的时间之内出现呼吸和循环的停止，因为脑干是人体的呼吸和循环中枢，急性大孔疝首先受累就是脑干。所以这方面发展的比较快，而瞳孔的变化则相对比较慢。
而对于小脑幕裂孔疝而言，他瞳孔的改变则会是首先出现的，一开始瞳孔是呈现出一个缩小的状态，主要是因为动眼神经受压刺激而导致。如果压迫时间过长，则可能动眼神经麻痹造成了瞳孔的散大，这个时候说明病情已经很严重了，需要及时的进行相应的手术治疗。