对于巴氏腺囊肿的女性，通常没有任何药物能够消肿，所以根本不存在巴氏腺囊肿消肿的特效药。
但如果女性是巴氏腺脓肿，那可以考虑使用抗生素来进行抗炎消肿，但并不是所有的巴氏腺脓肿，通过使用抗生素以后都可以使巴氏腺脓肿彻底消肿。
尤其是脓肿特别严重的女性，往往没办法使用药物来进行保守治疗，只能够考虑通过手术来治疗，而且不能行成常规的脓肿切除术，而应该行前庭大腺造口术。在手术后需要放置引流条，促进脓液的排出，这样才能够避免再次出现巴氏腺脓肿。