尖锐湿疣好发于性活跃的中青年，潜伏期一般为2周到8个月，平均为3个月。外生殖器及肛门周围皮肤粘膜湿润区为好发部位。男性多见于冠状沟、包皮、龟头、系带、尿道口、阴茎体、会阴。
同性恋者多见于肛门及直肠内，女性多见于大小阴唇、阴道口、阴蒂和阴道、宫颈、会阴及肛周。少数患者可见于肛门生殖器以外部位，如口腔、腋窝、乳房、趾间等。皮损初起为单个或多个散在的淡红色小丘疹。质地柔软，顶端尖锐，后渐增多增大。
根据疣体形态可分为无柄型型即丘疹样皮损和有柄型。后者可呈乳头状菜花状及蕈样状，疣体常呈白色、粉红色或污灰色，表面易发生糜烂、有渗液，及破溃、浸渍，尚可合并出血及感染。多数患者无明显自觉症状，少数可有异物感、灼痛、刺痒或性交不适。