虹膜新生血管的发病相对复杂，治疗棘手，大多不能仅靠吃药来治疗。
虹膜新生血管的治疗需要结合患者原发病因、具体病情等情况综合分析。虹膜新生血管大多不是独立的病症，多由其他眼部疾病继发。
在治疗虹膜新生血管时，应首先探明发病原因，积极治疗。例如原有视网膜动脉阻塞时，应给予溶栓、扩张血管药物治疗。对于虹膜新生血管，应及时给予类固醇类药物、抗新生血管药物治疗，必要时还应结合具体病情，给予激光手术、PDT治疗等，以最大程度挽救视力。