对于隐睾主要同先天性睾丸缺如相鉴别，因为隐睾主要是患者有睾丸，只不过是没有下降到正常的阴囊位置，而先天性睾丸缺如主要是患者并没有在胚胎发育时形成睾丸，因此是本身就没有睾丸的，所以不需要进行手术治疗。而隐睾一旦发现，在幼儿期间是需要进行隐睾下降固定手术的，在以后的生长发育过程当中下降到正常位置阴囊的睾丸可以产生正常功能的精子，如正常睾丸是一样的。
因此需要早发现早治疗，患者可以进行b超或者ct的检查，如果确定腹腔内或者腹股沟处有睾丸，那么就属于隐睾，如果阴囊空虚，但是全身检查没有发现有睾丸，那么说明是睾丸缺如。