川崎病的复查一般随访两年，也有一些对冠状动脉病变的随访到五年左右。川崎病的孩子主要的是因为并发冠状动脉的病变引起冠状动脉的扩张和冠状动脉瘤，所以在临床上要进行随访。
随访的过程主要是体格检查、心电图和心脏彩色超声波的检查，主要检查的是冠状动脉瘤的恢复情况。一般川崎病为自限性疾病，大多数预后都比较良好。
冠状动脉扩张或者冠状动脉瘤大约于病后的两年内会逐渐消失，但是有一些冠状动脉瘤比较大，而且有多发的冠状动脉瘤不容易消失。因此，需要随访的时间会更长一些，一般也在五年左右。冠状动脉瘤需要外科手术的介入治疗。