多年的肛瘘是有可能会癌变的。肛瘘是肛门附近不正常的瘘道，是细菌感染引起的，瘘管的内口在肛门里面，外口在肛周皮肤，可分为单纯性的肛瘘和复杂性的肛瘘。
通过做肛门指诊、探针检查，直肠内彩超、肛周磁共振检查就可以确诊肛瘘。临床治疗肛瘘，通过吃消炎药物以及坐浴的方法，只能缓解症状，需要手术治疗，才能根治肛瘘。
多年的肛瘘如果不治疗，肛周经常反复感染、流脓，会刺激局部的细胞发生基因突变，时间长了，可能会发生癌变。因此，肛瘘一旦形成，就需要尽快手术治疗。