阴道壁囊肿多数不会自行消失，但是有些比较小的阴道壁囊肿也可能会自行消失。
阴道壁囊肿属于良性的病变，大多数可能会由于局部组织损伤回流受阻导致，也可能会由于炎症感染导致。如果由于炎症感染导致的阴道壁囊肿，囊肿比较小，在炎症消退后可能会自行吸收后消失。如果是由于分娩、暴力性生活等原因，导致的阴道壁撕裂，造成的阴道壁囊肿，囊肿可能比较大，一般不会自行吸收。
如果囊肿比较小，没有疼痛、坠胀感等不适的感觉，不影响正常生活，可以严密观察，不用特殊处理。如果囊肿比较大，应该去医院进行手术治疗。