扁桃体发炎并不一定与流感有关系。流感是一种因为流感病毒感染导致的急性呼吸道疾病，患者在疾病发生以后，会出现明显的打喷嚏、流鼻涕的表现，同时伴随腰肌酸痛、身体发热、咳嗽、极度乏力等其它身体状况。
鼻道内的炎症以及鼻涕等分泌物，如果下行流入扁桃体，会对扁桃体黏膜造成刺激，有可能会诱发扁桃体发炎。
但是除了流感以外，患者的鼻炎、中耳炎等其它的上呼吸道感染性疾病，以及经常抽烟、喝酒等不良的生活习惯的刺激，也是可以诱发扁桃体发炎的情况出现。