肛瘘手术的假性愈合是由于肛瘘术后，切口皮肤出现早期愈合所导致，因为肛瘘切口大多偏深，侧面看去一般呈u字形，而正常的术后切口愈合是先从切口的最深处开始逐渐向上生长，最终肉芽组织填满整个切口后，然后皮肤愈合，这样就不会形成假性愈合。
而如果切口内的肉芽还没有填满整个切口，切口周围的皮肤出现了早期的愈合，这样就会导致假性愈合，而形成新的肛瘘。
所以肛瘘术后的患者一般需要定时换药，在切口内塞纱条，阻止切口两侧的皮肤出现早期愈合，防止假性愈合。