更年期肛门瘙痒可进行对症治疗，肛门处外涂止痒药膏，如糠酸莫米松软膏、派瑞松软膏，口服止痒药物氯雷他定，用中草药进行肛门熏洗、坐浴。
有神经衰弱者可给予镇静药物，也可以应用性激素和维生素进行治疗。更年期还要调整情绪，消除精神过度兴奋、抑郁等不良情绪。
更年期综合征是肛门瘙痒发病的因素之一，更年期因为卵巢功能衰退，体内的雌激素水平下降，会出现精神、情绪方面的变化，诱发肛门瘙痒。