心脏瓣膜反流的原因，可以分为生理性和病理性原因：
生理性原因，熬夜、过度劳累等情况下可以出现，二尖瓣或者单纯的二尖瓣或者是三尖瓣的少量反流。
病理性原因多是合并有器质性的心脏病变而引起。主要有一个是二尖瓣脱垂，这个是引起二尖瓣返流最常见的原因，高血压、心脏病，冠心病，风湿性心脏病，心肌病如扩张性心肌病等等可以引起二尖瓣关闭不全，出现反流，心脏超声检查可以看到心脏扩大，如左房扩大、左心室肥厚、二尖瓣纤维化增厚、健索乳头肌融合、缩短等等，三尖瓣反流经常见于先天性的心脏病，还有慢性的肺部疾病，肺心病，引起肺动脉压力增高，出现肺动脉关闭不全，还有肺动脉扩张，肺动脉病变等等情况，也可以引起三尖瓣返流的现象。
一般来说单纯的单个瓣膜轻度返流，多数是生理性反，而多个瓣膜轻度以上的中度或者是重度反流，多数是心脏存在器质性性病变而引起。