滥用抗生素会增加巧克力囊肿的患病风险，滥用抗生素会导致机体免疫力下降，机体免疫力遭到破坏，从而出现一些免疫性疾病。
虽然巧克力囊肿最主要的原因是经期经血倒流导致，是因为子宫内膜异位到卵巢上而形成。但是免疫与炎症因素，也增加巧克力囊肿的风险，比如系统性红斑狼疮的患者，巧克力囊肿的发病几率会更高。
所以，平时一定要规范的使用抗生素，而不要滥用抗生素；要注意休息，要作息规律，不要熬夜；要加强身体锻炼，提高机体免疫力。
平时也要做到不要在经期同房，经期不要剧烈运动，也不要游泳和盆浴，这些都可以防止经血逆流，预防巧克力囊肿。