间质性膀胱炎通常会使女性患者的肛门与阴道区域疼痛，使男性患者的肛门以及阴囊等区域疼痛。
在性生活时也会出现疼痛感，通常还伴有尿频、尿急等症状。由于膀胱受到了损伤，还会引起膀胱不适，主要表现为膀胱内的尿液充盈时，出现疼痛。在排尿以后，疼痛会逐渐缓解，并且膀胱容量也会逐渐减少。
由于间质性膀胱炎会导致慢性疼痛以及睡眠中断，容易使患者出现一些心理障碍，比如抑郁、焦虑等。轻度的间质性膀胱炎主要以药物治疗为主。如果药物治疗效果不佳，应采取手术治疗。