腹痛相关的脏器疾病较多，有消化系统疾病，如急慢性胃炎、急慢性肠炎、阑尾炎、胆囊炎、肠梗阻、胃肠道肿瘤等。泌尿系统疾病如急慢性肾盂肾炎、肾脏及输尿管结石、肾脏及膀胱肿瘤等，盆腔脏器疾病妇科炎症、异位妊娠等。
每种疾病所表现的腹痛性质有很大不同。例如消化系统疾病引起的腹痛，通常在上腹部较为明显，发病初期疼痛较轻，随着疾病进展逐渐加重，且常伴有恶心、呕吐、腹泻、大便性状改变等症状。
泌尿系统疾病引起的腹痛常在腹部一侧，疼痛开始时就较为剧烈，且持续不缓解，有时会和排尿行为有关。盆腔脏器疾病引起的腹痛主要针对女性患者，常发生在下腹部。