心脏搭桥的危险有心脏骤停。心脏搭桥的过程中需要对血管进行吻合，有些患者是在不停跳的情况下进行吻合。手术过程中会对患者的心脏造成刺激，还有可能会导致心肌缺血加重，有可能会诱发室颤使患者出现心脏骤停。
心脏搭桥过程中还有可能会出现不能复跳的危险。病情严重的患者需要进行体外循环使患者的心脏停跳，手术成功之后要进行心脏的复跳，如果复跳不成功患者就会发生死亡。
心脏搭桥过程中还容易发生电机制紊乱和严重的感染。