华支睾吸虫确诊的依据包括三个方面：
第一，患者有明确的到过疫区或疑似到过疫区的病史，从疫区回来之后才开始发病。
第二，影像学的检查。华支睾吸虫主要寄生在人体的肝脏内，可以通过彩超或CT对患者的肝脏进行检查，能够发现肝脏有占位性的病变。
第三，实验室的检查。可以对患者的粪便进行检查，临床上有多种方法对粪便进行检查，如果能够发现华支睾吸虫的虫卵，就可以明确诊断。还可以对患者的胆汁或十二指肠液进行检查，部分患者也可以发现虫卵。