小孩病毒性心肌炎多数是不会有后遗症现象发生，少数会遗留心脏早搏、心律失常可能。部分严重的病毒性心肌炎会遗留心脏扩大和心脏射血分数降低的表现，引起扩张型心肌病。
患者出现慢性心力衰竭反复发生，这是因为病毒性心肌炎是由于腺病毒，以及柯萨奇病毒感染引起心肌损伤的一种疾病。
这种心肌炎经过正规治疗，大部分患者心肌损伤不严重，预后良好，不遗留后遗症。少数心肌炎患者有可能出现心肌局部瘢痕形成，引起心脏早搏发生，但这种早搏一般也不会有严重的并发症。少数心肌炎由于心肌损伤严重，导致心室扩大，会引起扩张型心肌病改变。