脚趾缝溃烂可能是存在真菌感染，应使用抗真菌的药物治疗，比如酮康唑乳膏、克霉唑软膏等。在必要时还可配合口服伊曲康唑等药物治疗。
如果溃烂部位伴有明显渗液以及红肿的症状，可能是合并有细菌感染。应当先进行清创处理，然后使用低浓度的高锰酸钾溶液进行外洗，再外用抗生素类的软膏进行治疗，比如红霉素软膏。
在治疗的过程当中一定要做好护理，保持患处的清洁，不要进行剧烈的活动，选用透气的鞋袜。要清淡饮食，不要饮酒、吸烟，不要食用刺激性的食物。