引起扁平苔癣的原因比较复杂，具体原因现在还不是很明确，可能与精神因素、内分泌因素、免疫因素或者感染因素有关。
经常失眠、情绪波动或者女性在更年期以及经前期精神紧张，都可能会诱发扁平苔癣，或者是使扁平苔癣症状加重，去除这些因素后，扁平苔癣的病情可能会自行得到缓解。根据临床的研究证实，口腔扁平苔癣的主要是因为t细胞介导的炎症反应，使用糖皮质激素类药物以及免疫抑制剂治疗有效，这些都可以说明扁平苔藓癣可能与自身免疫有关。
另外，一些病毒或者细菌感染，也可能会引起扁平苔癣。扁平苔癣癣的治疗上首选糖皮质激素或者免疫抑制剂、免疫调节剂，配合局部外用糖皮质激素类的软膏或者是维甲酸类的药物。