肺动脉瓣关闭不全也会有一些并发症的。
肺动脉瓣关闭不全会使右心室的血液反流进入右心房，一方面增加了右心房的负荷，另一方面也增加了右心室的负荷，久而久之就可以引起右心衰，导致体循环淤血，会表现为身体低垂部位的水肿，胃肠道淤血水肿可以引起消化功能不良，甚至还有可能引起腹水。
肺动脉瓣关闭不全并发症的发生率并不高，大多数情况下会被能引起肺动脉瓣关闭不全的原发病的症状所掩盖。对于肺动脉瓣关闭不全在治疗上主要是针对原发病治疗，瓣膜病变以手术治疗为主。