卵巢囊肿的治疗时间，要看是生理性囊肿还是病理性囊肿，病理性囊肿是否有癌变，卵巢囊肿有多大。
如果是生理性卵巢囊肿，卵巢囊肿比较小，有可能是未破裂的卵泡，或者是排卵以后，黄体没有萎缩而形成的囊肿，这种情况一般无需治疗，一般在两个月经周期左右就会自然消失。如果是病理性卵巢囊肿，大部分是由于炎症引起的。如果卵巢囊肿没有超过五厘米以上，可以使用敏感的抗生素，加上中药或者中成药活血化瘀消炎治疗，一般三个疗程左右就能够痊愈；如果超过五厘米以上需要手术。
如果怀疑卵巢癌变，就需要做肿瘤标记物检查，确诊后再手术治疗。