萎缩性胃炎伴肠化生的治疗主要通过以下几方面：
第一，因为萎缩性胃炎伴肠化生时，主要是胃粘膜变薄，再生能力减低。所以，首先需要通过改变饮食结构，做到膳食均衡。
第二，对症治疗。若萎缩性胃炎伴肠化生是由于幽门螺旋杆菌感染引起，此时需要在医生的指导下进行根除幽门螺杆菌治疗。若出现了反酸、嗳气等症状，可以给予抑酸治疗。
第三，出现此症状后，会导致胃肠道营养缺乏，所以要及时的补充复合维生素。
第四，日常护理。戒烟酒，注意休息。