临床上喉粘液囊肿危害是：喉囊肿大者可出现喉鸣、呼吸困难、窒息、缺氧，严重者可造成不可逆的中枢神经系统损害，心脏、肝等全身多脏器损害。
喉部小囊肿如无症状可以观察，大囊肿、引起声嘶等症状的囊肿或有感染史的囊肿宜手术切除。
为了避免喉粘液囊肿的发生，平时注意口腔卫生，避免狼吞虎咽，不要进食辛辣刺激性食物，以免诱发囊肿发生。需要饮食清淡，多食用容易消化、吸收、富含维生素的食品，细嚼慢咽、饭后漱口，防止食物残渣存留诱发感染发炎。