感染性心内膜炎可以导致心肌脓肿，常见于急性感染性心内膜炎的患者。感染性心内膜炎多见于瓣膜性心脏病、先天性心脏病的病人。这些病人在有细菌感染时细菌粘附在瓣膜、赘生物上逐渐增大、脱落可以造成迁移性的脓肿。
心肌是比较常见受累及的部位，在心脏的任何部位都可以发生，但瓣膜的周围，特别是在主动脉瓣环周围常见，可以导致房室传导阻滞、室内传导阻滞。
心肌脓肿可以造成心脏的穿孔，感染性心内膜炎危害较重，应当给予早期、足量、长疗程的杀菌药物，尽快的控制病情。