新冠肺炎晚期时，要加强支持对症处理，维护器官的功能稳定来控制病情。
对于重症晚期新冠肺炎患者，在抗病毒治疗同时，一定要维护相应器官的功能稳定，例如呼吸衰竭的患者要予以气管插管、呼吸机辅助呼吸，视情况予以适量的糖皮质激素来减轻肺组织的炎性损伤。当有严重的低氧血症难以纠正时，还需要视情况予以体外膜肺的支持处理。
对于合并肝功能、肾功能等相应器官衰竭时，还可配合肾透析、血液滤过等综合治疗。通过上述的综合支持治疗，大多数新冠肺炎患者还是能得以治愈，仅有少数患者发生多脏器功能衰竭而临床死亡。