肛周脓肿不治疗并不会自己好。有些感染并不严重的肛周脓肿，不治疗靠自身的免疫力，也可以控制局部的感染。感染控制以后，局部的肿痛症状会逐渐消失。
虽然症状消失了，并不代表肛周脓肿已经完全痊愈了，最后在局部仍然会残留有硬结，而这个硬结和直肠内的肛隐窝是相通的，后期当感染物质经肛隐窝进入时，还是会再次引发脓肿而导致局部肿痛，最终还是需要通过手术治疗才能完全治愈。
所以，肛周脓肿的患者一经明确诊断，还是应该及时去医院进行手术治疗。