肠系膜脂膜炎就目前尚无特效治疗能够治愈疾病，所以主要是根据患者具体的症状，采取相应的对症治疗的措施，比如要注意加强营养支持治疗，也可以在合并有感染时应用抗感染药物治疗。
另外，针对患者病情活动期的一些全身症状，比如发热或者伴有明显的全身乏力、关节肌肉酸痛时，可以适当应用糖皮质激素联合非甾体抗炎药等进行治疗。
也可以联合免疫抑制剂，比如环磷酰胺、硫唑嘌呤等治疗。还可以适当应用纤维蛋白溶解药，或者应用某些中成药和中药等进行免疫调节。