男性生殖器部位的疣可用激光烧灼，或者液氮冷冻方式去除。疣是病毒感染引起，局部将疣体去掉后，还需要给予阿昔洛韦抗病毒药物治疗，可降低复发概率。
疣的复发跟自身免疫力有关，需要通过饮食结构改善，并且坚持每天适度运动，提高自身抗病免疫力，降低疣的复发几率。
生殖器疣具有一定传染性，治疗期间暂不要安排性生活，可避免性伴侣被感染，也可避免性摩擦刺激影响治疗恢复。
污染的内裤需要烫煮处理，病毒经过高温煮烫，可避免疣体反复生长。